Říční km	Popis
146.9	Nová Ves vl, Krabonoš vp vl začátek CHKO Třeboňsko
146.3	v 2,1 N vl Nová Ves 700 m vl (463 m n. m.), meandry, zarostlé úseky
136.7	Dvory n. L. 400 m vl Halámky 400 m vp Dvory n. L. 1,3 km vl (465 m n. m.) PR Horní Lužnice
133.4	v 2,0 N vp !! vývar, Na Primárně
132.9
127.6	v 0,5 stp konec PR
127.5	chatový tábor a TJ.Sokol vl vl, + 100 m loděnice vl
127.4	_VL v 1,9 dl N vl !!, +100m , kam.práh Tušť vp Suchdol n. L. vl vl vp Suchdol. zast. 400 m vl
126.4	stp za MV stř.
126	v 0,7 !!, +600m stp
125.1	Suchdol nad Lužnicí vl 500m vl U Pískovny, Pískovny 800 m vp 1,5km vl Suchdol n. L. 700 m vl
124.9	vodácká základna vp vp (445 m n. m.) romantický úsek s meandry a napadanými stromy v korytě dl. 8 km
123	Dračice, pískovna 500 m vl
121.5	Žabinec
117.8	chaty vp, RS vp, +700 m potrubí
116.9	odbočení Zlatá stoka (Zlatou stoku je zakázáno sjíždět, mimo zvláštní povolení rybářství Třeboň. Jedná se o umělý tok, který již splynul s přírodou. Napájí systém třeboňských rybníků. Celý úsek je dlouhý téměř 50 km. Protéká úzkým korytem s nízkými lávkami a občas napadanými stromy v řečišti, místy nad úrovní okolního terénu. Styčná místa jsou Herda, Branná, Třeboň, Smržov, Lomnice nad Lužnicí a Ponědrážka. Ústí do Lužnice na ř. km 77,1)
116.8	v 2,9 !! Pilař, smrtelně nebezpečný, včas přistát !!
116.6	Majdalena 700 m vl 1 km vl Hamr 2,5 km vp Chlum u Třeboně 3,5 km vp
116.5	stp
115.6	Koštěnický p., chatový tábor 200 m vp, +400 m stp stř. !! kameny
114.6	kam.práh za MV vp
113.5	Majdalena vl vl, Majdalena 300 m vl zast. Majdalena 500 m vl (437 m n. m.)
113.3	zátoka vl, kam. stupeň vl, dále občas stromy v korytě
111.8	, +200m stp zač. PR Meandry Lužnice, samoty U Tikalských vp
108.8	Rozvodí 2 segmenty, přenášení mezi nimi, při sklopeném segmentu !! prohlédnout, vp odbočuje Nová řeka, dále NPR Stará řeka, zarostlé, zapadané koryto, ale romantické
107.1	, +800 m samota U Bouckých vl
106.1	brod !!, samota U Dušáků 200 m vp
101.9	samota Holičky vl
100.9	pilíře býv. mostu, slepé rameno vl
100	zarostlé koryto, slepá ramena – obtížně průjezdný úsek dl. 3 km
97.7	Stará hlína vp vp konec NPR Stará řeka +50 m Třeboň 5 km vl 5km vl
96.5	začátek vzdutí rybníka Rožmberk, jeďte vp, pozor za větru !! vlny
93.2	hráz, přéšení vp od stavidel po schodech a zpět k vodě vp pod elektrárnu průtok ovlivněn elektrárnou, Rožmberská bašta vl, regulace koryta
92.7	potrubí
91.2	Lužnice vl vl
91.1	Lužnice vp vp
90.5	v 2,3 N vp , +100m stp
89	U Zahradníků vl, rybník Potěšil 300 m vp
87	Klec vp, Lomnice n. L. 1,5 km vl Lomnice n. L. 1,6 km vl 2km vl
86.7	stp
86.5	Klec vp
85.8	nízký !! za VV přenášet vp
85.4	v 2,6 !! klapkový , +50m Tisý p.
83.8	Frahelž 300 m vl 400m vl Frahelž 100 m vl
83.4	, kam. práh
83.2	kam.stp. vp !! za VV
82.7	rybníky vp vl
81.2	v 1,2 !! za VV, samota U Nohavů 500 m vp
80.5	stp stř., +100m
80.1	Vlkov 400m vp 700m vp Vlkov 700 m vp
79.3	kam.stp. vp +800m , rybníky, pískovny vp i vl
77.2	Zlatá stoka
76.4	potrubí
76	, +50m Veselí n. L. 100 m vl , konec CHKO Třeboňsko
75.2	Dekárka (z Nežárky)
75.1
75	, nízký !!, za VV přenést vp včetně následujícího jezu, Veselí nad Lužnicí vp vl vp vl vl Veselí n. L. 1,7 km vp
74.8	v 1,9 N vl !! válcový, Ostrov vp vp (405 m n. m.)
74.5	Nežárka, +100m stadion vl vl
73.9	Blatská stoka, potrubí
73.7	+50m
69.3	_VP v 1,5 !! N vl nebezpečný !! včas přistát, Dráchov vl vl
69.2	+100m Dráchov vp
68.5	Karvánky vp koupaliště vp PR Dráchovské tůně vl
67.1	_VL v 2,2 !! nebezpečný !! Čejnov
66.4	Dírenský p.( od rybníka Nadýmač cca 6 km, zarostlý tok, s čilým proudem, obtížnost ZW)
65	chatová osada, TJ Spartak vl vl
64.5	Soběslav vp vp Soběslav 700 m vp
64.2	Černovický p., Soběslav centrum vp
63.8	_VL v 1,0 !! N vl, larseny ve spád. desce 100m vp
63.5	Soběslav předměstí vp
62.6	chatový tábor vl
62	ostrov – levé rameno v 1,4 šikmý za VV !! – pravé rameno _VL v 1,4 N vp Špačkův mlýn, +700m
59.7	vp, Klenovice 700 m vp 1km vp
57.1	Skalice vl vl Pohoda 400 m vp
56.5	Pohoda 100 m vp, koupaliště, 300 m vp, pozor výstup přes soukromý pozemek !! Orion 600 m vp 600m vp
55.6	_VL v 1,0 !! larseny, Roudná vp vp Roudná 1 km vp, +400 m
54	kam.práh , +200 m RS vp, zast. Doubí u Tábora 500 m vp
53.4	3 prahy v úseku 1 km
51.4	samota Na Rybárně vl
49.9	Maršovský p., zátoka vl (plánované vp pod tratí)
48.1	vp u (dohoda) Planá nad Lužnicí vp vl vp vl vp vp Strkov 1 km vp 1,5km vp Planá 400 m vp (392 m n. m.)
48	v 1,5 !! larseny N vp U elektrárny, koupaliště vl
47.9	Planá vp vl
46.5	Sedlec vl
45.7	_VL v 1,2 !! N vl Soukeník 200 m vp u stadionu
45.4	Pod Soukeníkem vp, chaty vl Sezimovo Ústí II 1 km vp
43.9	vl u hřiště 100m vl
43.8	Kozský p.
43.7	Sezimovo Ústí I vp vp Kozí hrádek 4 km vp Sez. Ústí 1,5 km vp
43.2	v 1,5 !! N vp
42.2
40.6
40.5	_VP v 1,5 !! za VV Tábor vp Tábor 1,4km vp
39.8	_VL v 1,2 !! N vl za SV vl od propusti, Suchomel
39.7	Suchomelův ostrov vl vl (385 m n. m.)Tábořiště dle vodáků je zrušeno
39.4	Tábor vp Čelkovice vl vl vp vp
39	_VP v 1,4 !! vývar N vp, přenášení po zdi propusti vp jen za MV a SV
38.7	vysoký, Tábor vp Dolní Horky vl
38.3	_VP v 1,1 N vp !! dl. přenášení, Tismenice (Tismenice je velmi úzký, zarostlý potok, za VV z Košína, protéká Jordánem. Celý úsek je dlouhý cca 6 km, před ústím do Lužnice na výtoku rybníka pěkná kaskáda !!)
37.4	_VP v 1,0 Na Papírně provalený vp, peřej pod jezem, Klokoty 500 m vp 500m vp
36.8	_VL zbytky jezu býv. Benešův mlýn vp, peřej
36.5	ostrov, jeďte vp, peřej
36.2	tábořiště Harrachovka vp, +300 m , peřej
35.8	, peřej u ostrova, jeďte vl
34.8	v 1,0 N vp !! Kvěchtův mlýn
34.5	kamenné pole Stádo – peřej vp
33.4	v 1,0 N vp !! malou propustí vp od vorové propusti, je-li otevřena, Matoušovský mlýn, Slapský p.
32.5	Vlásenický p., peřeje
32	vl u chat
31.4	_VL zbytky jezu Bredův mlýn vl, peřeje 1 km
29.3	Příběnice vl vl v RS
27.3	_VL v 1,5 N vl !! larseny, Bejšovcův mlýn, Lužničanka 700 m vl
27	Bečice vl vl, Bečice 1 km vl 1km vl
26.4	Saloon Lužnice vl vl
25.8	zbytky Suchomel
24.1	(řetězový) Stádlec 2,5 km vp 2,5 km vp
24	_VP v 0,7 N vp !! U Marků, +100 m RS vp
22	v 1,6 !! larseny, propust vl v býv. náhonu, většinou zavřena, U Papírny
21.9	RS vp vl vl (označeno) vl
20	v 1,5 N vp !! larseny, Dobronice vp vp Dobronice 400 m vp
19.9	RS vl
16.4	Všechlapský p., peřej 200 m
15.6	Lišky vp vp, +200m Hutě vl vl
13.4	Na Říhovkách vl , vl
11.9	vysoký, Dubá, Bechyně 1 km vp, +100 m loděnice vp (360 m n. m.)
11.6	_VL v 1,6 N vp !! Horní mlýn
10.9	Bechyně Zářečí vl vl, Bechyně 500 m vp vp
10.7	_VL v 1,3 N vl !! Dolní mlýn, po 100 m Smutná
10.5	vodočet vl, peřej 200m
9.9	chatový tábor Židova strouha vl vl
9.6	vl, Nuzice 2 km vl
9	Židova strouha, visutý most vp (Židova strouha je za VV od mostu nad Nuzicemi, zpočátku zarostlé koryto, posléze větší spád a menší peřeje v jehličnatém lese, mírně zapadané stromy, max WW I, cca 6 km)
8.8	v RS vl vl
8	RS a Hvožďany vp vp
7.1	_VP v 1,5 N vl !! nebezpečný, v RS vl
5.1	U Velké skály vl
4.2	Koloděje nad Lužnicí vp vl vp vl, RS vp, začátek vzdutí PN Kořensko
0.5	RS Nový Dvůr 500 m vp 500m vp
0	do Vltavy v PN Kořensko na ř. km 202,2 (350 m n. m.), +21,2 km vp Červená n. Vlt. 500 m vp